MWC NU Ciledug memiliki badan otonom (banom) sebagai perangkat yang bertugas menjalankan program sesuai dengan basis keanggotaannya. Ketua Umum setiap banom dipilih oleh anggotanya melalui forum kongres. Banom memiliki Pedoman Dasar dan Pedoman Rumah Tangga tersendiri yang tidak bertentangan dengan Anggaran Dasar dan Anggaran Rumah Tangga Nahdlatul Ulama.

​

Berikut ini banom yang aktif di MWCNU Ciledug: